ai-110Đọc toàn bộ đề miễn phí

Khung Kiến Trúc Truyền Thông Điệp Tổng Quát MPNN (Gilmer et al. ICML 2017)

1. Tạo thông điệp (Message Function Mt):

AINâng cao45 phút

Tiến độ của tôi ở bài này

Điểm được lưu vào tài khoản sau khi chấm bài.

Đang tải điểm của bạn…

Kiến thức và chủ đề

gnnmpnnmessage-passingmolecular-graphspytorch

Kiến thức tiên quyết: graph-convolutional-network-gcn-layer.

Nội dung đề bài

Mục tiêu kiến thức

  • Gilmer et al. (2017) thống nhất hầu hết các mô hình GNN (GCN, GAT, GraphSAGE) vào một khung tổng quát gọi là Message Passing Neural Networks (MPNN) gồm 3 giai đoạn tại mỗi bước t:
  • Tạo thông điệp (Message Function Mt):

mij(t) = Mt(hi(t), hj(t), eij) (Thông điệp gửi từ đỉnh láng giềng j tới đỉnh i phụ thuộc vào trạng thái 2 đỉnh và đặc trưng cạnh eij).

  • Gom cụm thông điệp (Aggregation Function bigoplus):

mi(t) = bigoplusj ∈ Ni mij(t) (Phải là một toán tử bất biến hoán vị như ∑ hoặc mean).

  • Cập nhật trạng thái (Update Function Ut):

hi(t+1) = Ut(hi(t), mi(t)) (Thường dùng mạng MLP hoặc tế bào GRU).

Yêu cầu

Xây dựng lớp MPNNLayer(torch.nn.Module):

class MPNNLayer(nn.Module):
    def __init__(self, node_dim: int, edge_dim: int, out_dim: int, aggr: str = "sum"):
        pass

    def forward(self, h: torch.Tensor, edge_index: torch.Tensor, edge_attr: torch.Tensor) -> torch.Tensor:
        # h: (N, node_dim)
        # edge_index: (2, E) where edge_index[0] = source, edge_index[1] = target
        # edge_attr: (E, edge_dim)
        # Returns: (N, out_dim)
        pass
  • Message: M([h_src, h_dst, edge_attr]) qua một Linear layer (node_dim * 2 + edge_dim -> out_dim).
  • Aggregate: Dùng scatter_add hoặc lặp để gom thông điệp vào đỉnh đích target = edge_index[1].
  • Update: U([h_dst, m_aggregated]) qua Linear layer (node_dim + out_dim -> out_dim).

Input

  • Lớp MPNNLayer(node_dim, edge_dim, out_dim, aggr): Khởi tạo đối tượng với các tham số, trọng số hoặc cấu hình tương ứng.

Output

  • Các phương thức của MPNNLayer: Trả về kết quả tính toán hoặc cập nhật trạng thái nội bộ của đối tượng.

Ràng buộc

  • Thời gian chạy tối đa: 3000ms.
  • Giới hạn bộ nhớ: 256MB.
  • Dữ liệu đầu vào hợp lệ theo đúng kiểu dữ liệu và miền giá trị được mô tả.

Ví dụ 1

Input

node_dim, edge_dim, out_dim = (4, 2, 8)
mpnn = MPNNLayer(node_dim, edge_dim, out_dim)
h = torch.randn(2, node_dim)
edge_index = torch.tensor([[0], [1]], dtype=torch.long)
edge_attr = torch.randn(1, edge_dim)
mpnn(h, edge_index, edge_attr)

Output

[[ 0.0166, -0.0193, -0.1555,  0.1239,  0.2539,  0.1403, -0.0507, -0.0993],
 [ 0.0896,  0.2029,  0.0723, -0.2866, -0.3438, -0.0526, -0.3759,  0.2249]]

Giải thích

Hàm/lớp được gọi với các tham số mẫu trên và trả về kết quả số học / kích thước tensor tương ứng theo đúng thiết kế.

Ví dụ 2

Input

torch.manual_seed(42)
node_dim, edge_dim, out_dim = (4, 2, 8)
mpnn = MPNNLayer(node_dim, edge_dim, out_dim)
h = torch.randn(2, node_dim)
edge_index = torch.tensor([[0], [1]], dtype=torch.long)
e1 = torch.randn(1, edge_dim)
e2 = e1 + 10.0
out1 = mpnn(h, edge_index, e1)
out2 = mpnn(h, edge_index, e2)

Output

[[ 0.3727,  0.0455, -0.4174, -0.1621,  0.5048, -0.1361, -0.5602, -0.7397],
 [ 0.2055,  0.4013, -0.1843, -0.3846,  0.1103, -1.0218,  0.655 , -0.9531]]

Giải thích

Hàm/lớp được gọi với các tham số mẫu trên và trả về kết quả số học / kích thước tensor tương ứng theo đúng thiết kế.

3 cấp độ gợi ýMở dần khi bạn thật sự cần hỗ trợ.
Phân tích lời giảiGiải thích hướng tư duy và thuật toán.
Code tham khảoDùng để đối chiếu sau khi tự làm.

Gợi ý và lời giải chỉ mở sau khi bạn bấm Nộp bài. Giáo viên và quản trị viên mở được ngay.